❶ 钢之炼金术师或fa
在这个炼金术已经成为一门技术的时代，国家以优厚的待遇将许多善于炼金的人们集合起来，评选出精锐的炼金术师们为国效力。在军方的要求下，大批炼金术师被推上战场，而女孩温丽的双亲也作为医生上了战场，但他们由于连敌方的伤员也医救而被军方杀害。与温丽家的悲痛为伴，邻居爱德华与阿方索兄弟一家却陷入了艰难的等待中。身为国家炼金术师的父亲平时就沉迷于炼金术的研究，同温丽的父亲一同前往战场后就再也没有回来。母亲以孱弱的身体艰难地抚养着6岁的爱德华和5岁的阿尔方斯。这样的日子终于无法再坚持，生活的重担和疾病的折磨终于将母亲压倒，尽管兄弟两人和街坊们一起用尽全力拯救她，但世上最爱他们最关心他们的母亲，还是无法违抗命运的安排永远地闭上了眼睛。
守在母亲的墓前，爱德华和阿尔方斯哭尽了所有的眼泪，在绝望的黑暗中兄弟两人将父亲留下的炼金术资料当作了最后的希望之火，决定挑战炼金术最大的禁忌——人体炼成。然而当两人准备好人体的组成材料并按照文字的记载画出炼成阵时，出现在不安的光芒中的不是熟悉的母亲，而是一团烂肉和席卷一切的黑暗......炼金术里残酷的等价交换原则让兄弟两人付出了惨重的代价，爱德华失去了左腿，并用自己的右臂为代价救回了差点被吞没的阿尔方斯的灵魂，将他固定到一副铠甲上......
错已铸成，为了恢复原来的身体兄弟两人不得不直面残酷的命运。为了能更方便的寻找高级炼金术的资料，爱德华在12岁时便通过了国家炼金术师的考试，阿尔方斯虽然由于身体的原因无法参加考试，但却甘愿陪伴在哥哥身边一同寻找传说中的“贤者之石”。在炼金术被人们当作最后的希望而一再寄托着内心深处映照的时代里，带着残缺之身踏上旅途的爱德华和阿尔方斯，将见证一出又一出的人间活剧......
03出的时候漫画才到第8卷，所以30集（阿尔被绑架为分歧点）后期完全原创，大概占漫画（包括外传）情节的1/5左右。漫画和03版动画在主线剧情不一样，漫画里面有的人物03可能没有的，反之也是如此。09版/FA是遵循漫画原作剧情进行的动画，而03版非遵循，刚看的时候会感觉前面几话看过 ，因为03版前部分由漫画改编所致，小细节汇聚起来成为日后的巨大之差，各有各的优势。
03版TV目录
01：挑战太阳的人
02：禁忌的身体
03：妈妈……
04：爱的炼成
05：疾走！机械铠
06：国家炼金术师资格考试
07：合成兽恸哭之夜
08：贤者之石
09：军队走狗的银怀表
10：怪盗赛壬
11：砂砾的大地·上集
12：砂砾的大地·下集
13：焰 VS 钢
14：破坏的右手
15：伊修巴尔大屠杀
16：失去的东西
17：有家人等待的家
18：马尔科手记
19：真相中的真相
20：守护者的灵魂
21：红色光芒
22：被造出的人
23：钢铁之心
24：回忆的固定
25：别离的仪式
26：她的理由
27：师父
28：一即是全 全即是一
29：无垢的孩子
30：:南方司令部袭击
31：罪
32：深林中的但丁
33：被囚禁的艾尔
34：贪婪的理论
35：愚者的再会
36：我心中的罪人
37：焰之炼金术师/战斗吧少尉先生/第十三仓库的怪物
38：随川而流
39：东方内战
40：伤痕
41：圣母
42：不知其名
43：野狗出逃
44：光之霍恩海姆
45：劣化心灵之物
46：人体炼成
47:封印人造人
48：后会有期
49：到门的另一侧
50：死
51：慕尼黑1921
OVA
小孩篇 宴会篇 真实篇 国家炼金术师VS七大人造人
电影剧场版
香巴拉的征服者（遵循03版TV剧情）
在1923年11月魏玛共和国的德国慕尼黑。此时的德国正因第一次世界大战战败后所产生的通货膨胀经其伴随而来的贫困而喘息着，尽管如此，人民依然努力的活着。
延续着动画版最后一话，爱德华来到一个与炼金术世界非常遥远且完全无法使用炼金术的另一个世界，来到我们所处现实世界的爱德华为了寻找回到他原来世界的线索，便与他弟弟阿尔相似的另一个青年阿尔冯斯·海德利西一起制作火箭的研究，但对爱德而言，漫长的两年时光过去，相对地，能找出回到原来世界的机会也越来越渺茫。
一日、与阿尔冯斯一同前往嘉年华会的爱德遇到了一位名为“诺雅”吉普赛的女性。
拥有不可思议力量的她，有着只要借由接触对方就能看见被接触者的内心及想法的能力。她是被当时德国人称为“次等民族”的吉普赛人中的一员，然她们称自己则称为“诺玛”。
由于她的出现使得爱德华被卷入了当时德国纳粹正要发起的伟大计划之中即入侵一个名为香巴拉的国度，同时那也代表着炼金术世界将产生被毁灭的危机。
图利协会是怎样的一个组织？处于现实及炼金术世界，此两平行世界关系将被撕裂的爱德及阿尔，兄弟两人真有重逢的那天吗？当两人的手再度击掌的时候，炼金术的战斗即将开始。
在炼金世界中，存活下来的人造人少年拉斯带领爱德的弟弟阿尔作为开启门的付出代价牺牲掉自己及暴食的生命，回归母亲的身边。在我们所处现实世界中，化为青龙过去的人造人恩比和父亲霍恩海姆同归于尽而成为开启门的代价。为避免将来会发生的混乱，摧毁炼金术世界这一边的门的两兄弟滞留在另一个世界，根据自己的意志成为这一个世界的人活下去。
叹息之丘的神圣之星 （2011年7月2日上映）
09TV目录
01 钢之炼金术师
02 开端之日
03 邪教之街
04 炼金术师的苦恼
05 悲伤的雨
06 希望之路
07 隐藏的真相
08 第五研究所
09 被创造的记忆
10 各自的去向
11 拉修巴雷的奇迹
12 一即是全 全即是一
13 达普利斯的野兽们
14 地下潜伏者
15 东方的使者
16 战友的足迹
17 冷彻的火焰
18 矮小之人傲慢的手掌
19 不死之人的死
20 墓前的父亲
21 愚者的前进
22 远去的背影
23 战场上的少女
24 腹中
25 黑暗之门
26 再会
27 夹缝之宴
28 父亲大人
29 愚者的挣扎
30 伊修巴尔歼灭战
31 520元的约定
32 总统之子
33 布利古兹的北壁
34 冰之女王
35 本国的形态
36 家族的肖像
37 起始人造人
38 巴兹库尔的激斗
39 白日之梦
40 烧瓶中的小人
41 奈落
42 反击的征兆
43 蚂蚁的反击
44 完全恢复
45 约定之日
46 迫近之影
47 暗之使者
48 地道中的誓言
49 亲子之情
50 森特拉尔的动乱
51 不死的军团
52 众人之力
53 复仇之炎
54 烈火的前方
55 大人们的生存之态
56 总统归来
57 永远的休假
58 人柱
59 失去的光明
60 天之瞳 地之扉
61 噬神者
62 惨烈的反击
63 门的另一侧
64 旅途生涯 最终回
外传
1：盲目的炼金术师
2：单纯的人们
3：师匠物语
4：那也是他的战场