❶ 鋼之煉金術師或fa
在這個煉金術已經成為一門技術的時代，國家以優厚的待遇將許多善於煉金的人們集合起來，評選出精銳的煉金術師們為國效力。在軍方的要求下，大批煉金術師被推上戰場，而女孩溫麗的雙親也作為醫生上了戰場，但他們由於連敵方的傷員也醫救而被軍方殺害。與溫麗家的悲痛為伴，鄰居愛德華與阿方索兄弟一家卻陷入了艱難的等待中。身為國家煉金術師的父親平時就沉迷於煉金術的研究，同溫麗的父親一同前往戰場後就再也沒有回來。母親以孱弱的身體艱難地撫養著6歲的愛德華和5歲的阿爾方斯。這樣的日子終於無法再堅持，生活的重擔和疾病的折磨終於將母親壓倒，盡管兄弟兩人和街坊們一起用盡全力拯救她，但世上最愛他們最關心他們的母親，還是無法違抗命運的安排永遠地閉上了眼睛。
守在母親的墓前，愛德華和阿爾方斯哭盡了所有的眼淚，在絕望的黑暗中兄弟兩人將父親留下的煉金術資料當作了最後的希望之火，決定挑戰煉金術最大的禁忌——人體煉成。然而當兩人准備好人體的組成材料並按照文字的記載畫出煉成陣時，出現在不安的光芒中的不是熟悉的母親，而是一團爛肉和席捲一切的黑暗......煉金術里殘酷的等價交換原則讓兄弟兩人付出了慘重的代價，愛德華失去了左腿，並用自己的右臂為代價救回了差點被吞沒的阿爾方斯的靈魂，將他固定到一副鎧甲上......
錯已鑄成，為了恢復原來的身體兄弟兩人不得不直面殘酷的命運。為了能更方便的尋找高級煉金術的資料，愛德華在12歲時便通過了國家煉金術師的考試，阿爾方斯雖然由於身體的原因無法參加考試，但卻甘願陪伴在哥哥身邊一同尋找傳說中的「賢者之石」。在煉金術被人們當作最後的希望而一再寄託著內心深處映照的時代里，帶著殘缺之身踏上旅途的愛德華和阿爾方斯，將見證一出又一出的人間活劇......
03出的時候漫畫才到第8卷，所以30集（阿爾被綁架為分歧點）後期完全原創，大概占漫畫（包括外傳）情節的1/5左右。漫畫和03版動畫在主線劇情不一樣，漫畫裡面有的人物03可能沒有的，反之也是如此。09版/FA是遵循漫畫原作劇情進行的動畫，而03版非遵循，剛看的時候會感覺前面幾話看過 ，因為03版前部分由漫畫改編所致，小細節匯聚起來成為日後的巨大之差，各有各的優勢。
03版TV目錄
01：挑戰太陽的人
02：禁忌的身體
03：媽媽……
04：愛的煉成
05：疾走！機械鎧
06：國家煉金術師資格考試
07：合成獸慟哭之夜
08：賢者之石
09：軍隊走狗的銀懷表
10：怪盜賽壬
11：砂礫的大地·上集
12：砂礫的大地·下集
13：焰 VS 鋼
14：破壞的右手
15：伊修巴爾大屠殺
16：失去的東西
17：有家人等待的家
18：馬爾科手記
19：真相中的真相
20：守護者的靈魂
21：紅色光芒
22：被造出的人
23：鋼鐵之心
24：回憶的固定
25：別離的儀式
26：她的理由
27：師父
28：一即是全 全即是一
29：無垢的孩子
30：:南方司令部襲擊
31：罪
32：深林中的但丁
33：被囚禁的艾爾
34：貪婪的理論
35：愚者的再會
36：我心中的罪人
37：焰之煉金術師/戰斗吧少尉先生/第十三倉庫的怪物
38：隨川而流
39：東方內戰
40：傷痕
41：聖母
42：不知其名
43：野狗出逃
44：光之霍恩海姆
45：劣化心靈之物
46：人體煉成
47:封印人造人
48：後會有期
49：到門的另一側
50：死
51：慕尼黑1921
OVA
小孩篇 宴會篇 真實篇 國家煉金術師VS七大人造人
電影劇場版
香巴拉的征服者（遵循03版TV劇情）
在1923年11月魏瑪共和國的德國慕尼黑。此時的德國正因第一次世界大戰戰敗後所產生的通貨膨脹經其伴隨而來的貧困而喘息著，盡管如此，人民依然努力的活著。
延續著動畫版最後一話，愛德華來到一個與煉金術世界非常遙遠且完全無法使用煉金術的另一個世界，來到我們所處現實世界的愛德華為了尋找回到他原來世界的線索，便與他弟弟阿爾相似的另一個青年阿爾馮斯·海德利西一起製作火箭的研究，但對愛德而言，漫長的兩年時光過去，相對地，能找出回到原來世界的機會也越來越渺茫。
一日、與阿爾馮斯一同前往嘉年華會的愛德遇到了一位名為「諾雅」吉普賽的女性。
擁有不可思議力量的她，有著只要藉由接觸對方就能看見被接觸者的內心及想法的能力。她是被當時德國人稱為「次等民族」的吉普賽人中的一員，然她們稱自己則稱為「諾瑪」。
由於她的出現使得愛德華被捲入了當時德國納粹正要發起的偉大計劃之中即入侵一個名為香巴拉的國度，同時那也代表著煉金術世界將產生被毀滅的危機。
圖利協會是怎樣的一個組織？處於現實及煉金術世界，此兩平行世界關系將被撕裂的愛德及阿爾，兄弟兩人真有重逢的那天嗎？當兩人的手再度擊掌的時候，煉金術的戰斗即將開始。
在煉金世界中，存活下來的人造人少年拉斯帶領愛德的弟弟阿爾作為開啟門的付出代價犧牲掉自己及暴食的生命，回歸母親的身邊。在我們所處現實世界中，化為青龍過去的人造人恩比和父親霍恩海姆同歸於盡而成為開啟門的代價。為避免將來會發生的混亂，摧毀煉金術世界這一邊的門的兩兄弟滯留在另一個世界，根據自己的意志成為這一個世界的人活下去。
嘆息之丘的神聖之星 （2011年7月2日上映）
09TV目錄
01 鋼之煉金術師
02 開端之日
03 邪教之街
04 煉金術師的苦惱
05 悲傷的雨
06 希望之路
07 隱藏的真相
08 第五研究所
09 被創造的記憶
10 各自的去向
11 拉修巴雷的奇跡
12 一即是全 全即是一
13 達普利斯的野獸們
14 地下潛伏者
15 東方的使者
16 戰友的足跡
17 冷徹的火焰
18 矮小之人傲慢的手掌
19 不死之人的死
20 墓前的父親
21 愚者的前進
22 遠去的背影
23 戰場上的少女
24 腹中
25 黑暗之門
26 再會
27 夾縫之宴
28 父親大人
29 愚者的掙扎
30 伊修巴爾殲滅戰
31 520元的約定
32 總統之子
33 布利古茲的北壁
34 冰之女王
35 本國的形態
36 家族的肖像
37 起始人造人
38 巴茲庫爾的激斗
39 白日之夢
40 燒瓶中的小人
41 奈落
42 反擊的徵兆
43 螞蟻的反擊
44 完全恢復
45 約定之日
46 迫近之影
47 暗之使者
48 地道中的誓言
49 親子之情
50 森特拉爾的動亂
51 不死的軍團
52 眾人之力
53 復仇之炎
54 烈火的前方
55 大人們的生存之態
56 總統歸來
57 永遠的休假
58 人柱
59 失去的光明
60 天之瞳 地之扉
61 噬神者
62 慘烈的反擊
63 門的另一側
64 旅途生涯 最終回
外傳
1：盲目的煉金術師
2：單純的人們
3：師匠物語
4：那也是他的戰場